一种基于蛋白质的拓扑与功能特征的关键蛋白识别方法

摘要

越来越多的研究表明，酿酒酵母中已发现了大量的蛋白‑蛋白相互作用(PPI)数据，对酵母关键蛋白质识别具有重大意义。到目前为止，已经有一系列从PPI网络预测关键蛋白质的计算方法。然而，这些计算方法的预测精度不能令人十分满意。本发明通过对蛋白基因表达数据进行皮尔逊相关系数(PCC)处理，将原始的PPI网络首先转化为加权的PPI网络。然后，根据加权PPI网络和同源蛋白的信息，提取加权PPI网络中每个蛋白的一些关键网络拓扑特征和蛋白功能特征。根据这些新提取的蛋白质拓扑特征和功能特征，构建一种迭代方法用于基本蛋白质的预测。本发明通过整合蛋白质的功能和网络拓扑特性，有效提高基本蛋白质的预测精度，显著优于现有预测方法的预测精度。