一种实验数据辅助的自适应策略蛋白质结构预测方法

摘要

一种实验数据辅助的自适应策略蛋白质结构预测方法，在进化算法框架下，首先，种群初始化，根据轮盘赌的方法选择不同的变异策略对构象进行变异，交叉；其次利用SAXS实验数据计算模型相似性差用以辅助Rosetta能量函数score3对构象进行选择，同时通过蒙特卡洛概率接收准则保持选择过程中构象的多样性，根据构象更新的历史信息动态更新变异策略的选择概率；实验数据辅助的自适应策略蛋白质结构预测方法利用了现有的SAXS实验数据辅助结构预测，不仅能够缓解能量函数不精确的问题，而且可以根据历史信息引导算法采样提高算法适应性以及采样效率。本发明采样效率高、预测精度高。