一种基于二面角信息辅助能量函数选择的蛋白质结构预测方法

摘要

一种基于二面角信息辅助能量函数选择的蛋白质结构预测方法，首先，根据蛋白质残基对应的拉氏图Ramachandran plot中提取二面角信息；其次，使用Rosetta算法中的能量函数以及二面角信息对构象进行评估；然后，分别给予两个分数以不同的权重，设计一个新的打分函数，使用这个打分函数对片段组装后的构象进行选择，从而减小能量函数不精确对蛋白质三维结构产生的影响；最后，对构象进行全局搜索以及局部搜索，在保证构象全局拓扑结构的基础上，对局部的结构进行增强，从而获得更多的近天然态的结构。本发明提供一种采样能力较好、预测精度较高的基于二面角信息辅助能量函数选择的蛋白质结构预测方法。