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多类生物序列注释的整合方法

摘要

本发明公开了一种多类生物序列注释的整合方法,包括:从生物测序数据中选取一种生物测序数据作为主要生物序列集,其余的作为辅助生物序列集;建立序列‑基因关联映射集;据基因转录起始点获取该基因的基础关联区域和扩展关联区域;对于主要生物序列集的序列,遍历基因的扩展关联区域,若序列所在的区域和某个基因的扩展关联区域有交集,则建立基因和序列的序列‑基因关联映射;对参考数据应用于序列‑基因关联映射集中的生物序列注释的结果采用超几何检验、二项检验计算显著性;对两种方法得到的注释分别排序,并对相同的注释的排序的序号相加后再次排序作为多种生物序列数据的注释结果。本发明实现综合各种特征的注释,在医疗领域具有应用价值。

著录项

  • 公开/公告号CN110223732B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-04-06

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 清华大学;

    申请/专利号CN201910411387.2

  • 发明设计人 江瑞;宋绍铭;

    申请日2019-05-17

  • 分类号G16B30/10(20190101);

  • 代理机构11327 北京鸿元知识产权代理有限公司;

  • 代理人董永辉;李玉琦

  • 地址 100084 北京市海淀区100084信箱82分箱清华大学专利办公室

  • 入库时间 2022-08-23 11:37:59

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