本发明涉及分子生物学，具体公开了与玉米粗缩病抗性相关的KASP分子标记及其应用。所述分子标记定位于玉米第8号染色体上，命名为CSB‑2、CSB‑5、CSB‑6和CSB‑7。CSB‑2如SEQ ID NO.1所示，在第201bp处发生G→A的突变，碱基A为抗粗缩病玉米材料所特有；CSB‑5如SEQ ID NO.2所示，在第204bp处发生TTAAATAT的插入，插入片段为抗粗缩病玉米材料所特有；CSB‑6如SEQ ID NO.3所示，在第201bp处发生C→G突变，碱基G为抗粗缩病玉米材料所特有；CSB‑7如SEQ ID NO.4所示，在第101bp处发生SEQ ID NO.5所示序列的插入突变后，表现出玉米粗缩病抗性。本发明提供的与玉米粗缩病抗性相关的KASP分子标记可用于粗缩病抗病分子育种和玉米种质资源分析，同时具有成本相对较低和应用灵活性高的特点，可实现高通量检测。
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