一种新的基于元胞自动机的蛋白质进化仿真模型

摘要

本发明提供一种新的基于元胞自动机的蛋白质进化仿真模型，包括以下步骤：使用关键词￠在NCBI数据库中找到属于蛋白质家族￠的所有蛋白质，通过这些蛋白质的ID号到Uniport数据库中找到蛋白质家族￠的结构域信息，构成进化仿真模型的训练数据集；通过训练数据集中的数据得到蛋白质家族￠的公共结构域，通过由前向后进化先验概率表Ф和由后向前进化先验概率表Э，得出蛋白质家族￠的其它结构域在公共结构域前面和后面出现的概率；仿真出一条新的蛋白质序列，蛋白质序列以结构域连接的形式给出。本发明提出的方法具有模型简单、仿真度高的优点，具有广阔的运用前景。