一种利用|Δ(SNP-index)|进行性状定位的QTL-seq方法及其应用

摘要

一种利用|Δ(SNP‑index)|进行性状定位的QTL‑seq方法及其应用，该方法以参考基因组代替亲本之一的基因组作为参照计算子代池SNP‑index，用Δ(SNP‑index)的绝对值|Δ(SNP‑index)|代替Δ(SNP‑index)用于滑动窗口法性状定位分析，通过对双亲具有相同表型的分离群体的极端表型池进行QTL‑seq分析，并利用|Δ(SNP‑index)|的分布进行目标性状基因或主效QTL的定位预测，改变了常规QTL‑seq方法只能应用于双亲纯合且具有相对性状的分离群体的状况，使QTL‑seq方法能够应用于双亲具有相同性状的分离群体，极大地拓展了QTL‑seq方法的应用范围，具有很好的应用前景。应用该方法对双亲均为红皮东方梨的“满天红”ד红香酥”杂交组合红皮表型池和绿皮表型池进行分析，将东方梨红皮/绿皮性状位点定位在1.86Mb的区间内。