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用于鱼类群落结构研究的环境DNA鉴定方法

摘要

本发明涉及一种用于鱼类群落结构研究的环境DNA鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤(1):根据鱼类群落所在水域的大小,采集水样;步骤(2):将水样进行处理后,提取其中的总环境DNA;步骤(3):将总环境DNA采用核苷酸序列为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2的16s rDNA序列作为通用引物进行PCR扩增,得到PCR产物;步骤(4):将PCR产物进行凝胶电泳,得到带有DNA的凝胶;步骤(5):将带有DNA的凝胶进行切胶克隆测序后通过GENBANK进行blast比对,以确定DNA是否为鱼类序列;步骤(6):确定DNA为鱼类序列后,采用二代测序技术对PCR产物的组成情况进行大规模分析,以确定环境中DNA的鱼群的组成和鱼类的群落结构。采用该方法十分简便高效,具有实用价值。

著录项

  • 公开/公告号CN104531879B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-02-22

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海海洋大学;

    申请/专利号CN201510005835.0

  • 申请日2015-01-06

  • 分类号

  • 代理机构上海智信专利代理有限公司;

  • 代理人王洁

  • 地址 201306 上海市浦东新区临港新城沪城环路999号

  • 入库时间 2022-08-23 09:52:32

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-02-22

    授权

    授权

  • 2015-05-20

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q 1/68 申请日:20150106

    实质审查的生效

  • 2015-04-22

    公开

    公开

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