用于估计结合亲和力的预测性得分函数

摘要

用于计算所提议的配体与指定受体之间相互作用的数值表示(VRI)的计算机执行的方法。通过因受体对一个或多个配体原子的疏水包围的存在而给予加分的方法，给在一个或多个配体原子和一个或多个受体原子之间的疏水相互作用评分。此外，通过为电荷-电荷氢键设定一个缺省值，并且当一个或多个专门的预定的电荷-电荷氢键标准被满足时，在所述缺省值以上给予加分，来给配体和受体之间的电荷-电荷氢键评分。使用各种电荷-电荷氢键标准。考虑了两性离子、电荷、溶剂化作用、几何形状和静电能。