一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法

摘要

本发明公开了一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法，包括：测定竹叶花椒与其芽变品种荣昌无刺花椒三个不同发育时期叶片中的萜类化合物的成分及含量；提取叶片的总RNA构建测序文库，数据分析并功能注释。预测了CDS、SSR、lncRNAs和As事件，分析差异表达基因并筛选与萜类化合物生物合成相关的结构基因与转录因子的差异表达基因；构建共表达基因网络，将hub基因的FPKM值与萜类化合物含量进行相关性分析，选取与萜类化合物含量正相关的基因作为其合成相关基因。本发明成功构建了花椒高质量的转录本，揭示了12个可能参与调节萜类化合物合成的关键基因，为解析花椒叶片萜类物质生物合成的分子机制奠定了基础。