首页> 中国专利> 鉴定基因组串联重复区域的方法及装置

鉴定基因组串联重复区域的方法及装置

摘要

本发明公开了一种鉴定基因组串联重复区域的方法及装置。其中,该方法包括以下步骤:S1,统计基因组fasta文件每条染色体的长度;S2,使用软件对基因组的串联重复序列进行预测;S3,对预测的串联重复序列进行过滤;S4,结合S1中得到的染色体的长度,对滤后的过串联重复序列进行统计;S5,将每条染色体上的过滤后的串联重复序列单独提取出来;S6,对每条染色体的过滤后的串联重复序列进行聚类;S7,对潜在串联重复区域分布位置进行统计与过滤。应用本发明的技术方案,不需要已知着丝粒区域重复单元序列,即可实现染色体水平基因组着丝粒区域的鉴定。

著录项

  • 公开/公告号CN115273984A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-11-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京诺禾致源科技股份有限公司;

    申请/专利号CN202211205346.6

  • 申请日2022-09-30

  • 分类号G16B30/20;G16B40/00;

  • 代理机构北京康信知识产权代理有限责任公司;

  • 代理人金田蕴

  • 地址 102200 北京市昌平区回龙观镇生命园路29号创新大厦B258室

  • 入库时间 2023-06-19 17:24:03

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-11-01

    公开

    发明专利申请公布

相似文献

  • 专利
  • 中文文献
  • 外文文献
获取专利

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号