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基于对比学习的合成致死基因搭档的推荐方法、装置、终端及介质

摘要

本申请公开了一种基于对比学习的合成致死基因搭档的推荐方法、装置、终端及介质,通过获取基因数据,将基因数据中的待匹配基因和被推荐基因分别组成多个候选基因对,将候选基因对输入训练完毕的对比学习模型得到各候选基因对的基因嵌入,基于各候选基因对的基因嵌入,计算各候选基因对中两基因的相似度,作为各候选基因对的得分结果,选定得分最高的候选基因对中的被推荐基因作为待匹配基因的合成致死基因搭档。本申请利用对比学习框架达到仅用已知的合成致死基因作为正样本训练模型并推荐合成致死基因搭档的效果,排除现有技术对负样本的依赖,有效缓解基因样本的稀缺问题,较现有技术相比具备优越的预测性能。

著录项

  • 公开/公告号CN115240778A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-10-25

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海科技大学;

    申请/专利号CN202210957122.4

  • 申请日2022-08-10

  • 分类号G16B40/00;G16B5/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08;G06N20/00;

  • 代理机构上海光华专利事务所(普通合伙);

  • 代理人倪静

  • 地址 201210 上海市浦东新区华夏中路393号

  • 入库时间 2023-06-19 17:19:11

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-10-25

    公开

    发明专利申请公布

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