首页> 中国专利> 循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置

循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置

摘要

本发明提供了一种循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置,包括:接收待分析血浆样本的甲基化测序数据并从中提取循环无细胞DNA分子片段;提取转录因子结合位点上下游区域CpG位点的甲基化状态;以转录因子结合位点的基因组位置作为参照,将其上下游区域的CpG位点的坐标对齐;针对每个转录因子,分别统计各相对坐标上甲基化的CpG分子片段占比;计算转录因子结合位点中心点与侧翼区域的甲基化占比差值;将甲基化占比差值输入甲基化水平分析模型,根据甲基化水平分析模型的输出结果完成对待分析血浆样本循环无细胞DNA转录因子结合位点甲基化水平的分析,实现通过甲基化数据对转录因子的集合状态进行评估的目的。

著录项

  • 公开/公告号CN115132274A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-09-30

    原文格式PDF

  • 申请/专利号CN202211059714.0

  • 发明设计人 吕芳;黄宇;陈维之;杜波;

    申请日2022-09-01

  • 分类号G16B20/30;G16B30/10;G16B30/20;

  • 代理机构常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人王巍巍

  • 地址 100192 北京市海淀区宝盛南路1号院26号楼3层310号

  • 入库时间 2023-06-19 17:01:21

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-09-30

    公开

    发明专利申请公布

相似文献

  • 专利
  • 中文文献
  • 外文文献
获取专利

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号