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一种用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法

摘要

本发明提供了一种用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法,采用本发明方法制得的复性单链抗体重组蛋白溶液,该单链抗体重组蛋白所处的溶剂即为使用者后续实验所需的缓冲液,无需再进行缓冲液的置换,同时最终产物中单链抗体蛋白的浓度能达到30mg/mL以上,单链抗体复性率达到20%以上,最终置换蛋白与复性单链抗体蛋白的比例达到30%以上。本发明变复性方法适用于大肠杆菌表达得到的曲妥珠单链抗体蛋白,同时也适用于与曲妥珠单链抗体蛋白序列同源性达到60%以上的单链抗体蛋白。

著录项

  • 公开/公告号CN114891109A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-08-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 华东师范大学;

    申请/专利号CN202210550377.9

  • 申请日2022-05-20

  • 分类号C07K16/32(2006.01);C12N15/70(2006.01);C07K1/34(2006.01);C07K1/14(2006.01);C07K1/107(2006.01);

  • 代理机构上海湾谷知识产权代理事务所(普通合伙) 31289;

  • 代理人倪继祖

  • 地址 200062 上海市普陀区中山北路3663号

  • 入库时间 2023-06-19 16:22:17

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-08-30

    实质审查的生效 IPC(主分类):C07K16/32 专利申请号:2022105503779 申请日:20220520

    实质审查的生效

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域,具体涉及用于曲妥珠单链抗体和其它序列同源于曲妥珠单链抗体的单链抗体的变复性方法。

背景技术

外源蛋白在大肠杆菌中高效表达导致不溶性的聚集形成高密度的包涵体。蛋白变性主要是蛋白质分子内部的结构被破坏。天然蛋白质的空间结构是通过氢键等次级键维持,而变性后次级键被破坏,蛋白质分子从原来有序的卷曲的紧密结构变为无序的松散的伸展状结构。原本位于分子内部的疏水基团大量暴露于分子表面,而亲水基团在表面分布相对较少,使得蛋白颗粒不能与水相溶而失去水膜,引起分子间的碰撞而聚集沉淀。

单链抗体(ScFv)具有可去除非特异性反应的竞争性表面蛋白,肿瘤显象背景更加清晰性,易渗透肿瘤组织中增加药物治疗浓度等多个显著的优点,大肠杆菌表达再通过变复性获得的抗体蛋白,具有生长迅速,生产成本低,产率高以及相对容易的基因操作等优点,成为制备单链抗体(ScFv)常用方法之一。但在利用这种高表达系统时存在的挑战在于蛋白体外折叠时会产生大量的错误折叠和聚集。在去除变性剂使得目标蛋白从完全伸展的变性状态恢复至正差的折叠结构、去除还原剂确保二硫键正常形成的复性过程中,回收正确折叠的蛋白效率低。

传统的复性方法有稀释法和透析法。稀释复性法对样品几十倍甚至上百倍的稀释会使样品的体积急剧增大,给后续的分离纯化带来很大的困难。透析法耗时较长,而且要多次更换透析溶液。这两种方法的共同缺点在于蛋白质在复性过程中会发生聚集而产生大量沉淀,使得复性效率低,通常蛋白质的活性回收率只有5~20%,而且复性后的蛋白质溶液中含有大量的杂蛋白,需要进行进一步的分离纯化。复性后的蛋白所存在的缓冲液中一般含有精氨酸等杂质与下游的步骤不兼容,且无法长时间储存蛋白溶液。缓冲液的置换是生物样品制备过程中必不可少的步骤,既能为下游应用制备样品,也能支持后续的长期储存。缓冲液置换的常用方法有透析、脱盐柱等。透析置换依赖于被动扩散,可能需要长达24小时的时间才能完成置换。脱盐柱是在高分子量和低分子量物质之间进行基团分离,从盐和其他小分子中分离出来的蛋白质,样品被脱盐转移到一个新的缓冲液中。并且置换缓冲液过程中由于浓度、pH、环境温度等变化会对蛋白量进行二次损伤。

通过大肠杆菌表达得到的曲妥珠单链抗体蛋白,其变复性过程中也存在以上问题:如使用透析复性时,将6M的盐酸胍蛋白变性剂加入750mL复性液中,从6M降至1M盐酸胍时,蛋白浓度为1.8mg/mL;但当1M盐酸胍降至0M时,蛋白几乎全部析出。

所以,生产高质量的,副产物和杂质少的单链抗体是关键挑战,即使用蛋白质变复性方法回收获得蛋白过程充满复杂性。

因此,如何实现在获得高浓度曲妥珠单链抗体蛋白的同时还能通过变复性处理后直接置换到所需缓冲液中是本领域技术人员致力于研发的方向之一。

发明内容

本发明的目的,就是为了解决上述问题而提供了一种用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法,能将单链抗体蛋白直接置换到所需缓冲液中,并且可以获得高浓度单链抗体蛋白。

本发明的目的是这样实现的:

本发明提供了一种用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法,所述曲妥珠单链抗体或与其序列同源的单链抗体蛋白通过大肠杆菌表达系统诱导表达,经细胞破碎、离心后制备得到单链抗体重组蛋白包涵体,所述变复性方法包括以下步骤:

步骤S1:将单链抗体重组蛋白包涵体用洗涤液进行洗涤并离心,得到的沉淀再用细胞破碎液洗涤、离心重复三次,得到沉淀为纯化的单链抗体重组蛋白包涵体;

步骤S2:将步骤S1得到的纯化的单链抗体重组蛋白包涵体用变性剂彻底溶解,按照1克包涵体加入5mL变性剂的比例,对变性的重组蛋白溶液进行搅拌,搅拌速度为100-150rpm,搅拌温度为4℃,搅拌时间为12小时,搅拌后离心取上清液,得到变性蛋白液,并将其蛋白浓度调整为30mg/mL;传统认为复性时加入蛋白浓度控制在0.1-1.0mg/mL,过快会形成絮状沉淀。但通过实验发现传统的蛋白添加浓度回收效率极低。本发明通过多次实验将蛋白浓度提至30mg/mL,同时缓慢搅拌,最后成功复性。

步骤S3:取9mL变性蛋白液平均分为三剂,每剂之间间隔两小时,缓慢滴入1L的复性液中,滴加完毕后在100-150rpm、4℃条件下搅拌24小时,得到复性蛋白液;

步骤S4:将步骤S3制得的复性蛋白液离心,上清液经4℃冰浴后抽滤去除沉淀,得到的蛋白溶液通过超滤膜包浓缩至20mL,再次离心后取上清得到浓缩复性蛋白溶液;

步骤S5:将步骤S4制得的浓缩复性蛋白溶液按照1:6的体积比缓慢倒入蛋白复性后实验所需的缓冲液中,4℃环境下搅拌12小时,经过离心和抽滤去除沉淀后,得到置换后的蛋白溶液;

步骤S6:将步骤S5制得的置换后的蛋白溶液的蛋白浓度浓缩至8mg/mL,通过分子筛进行纯化分离,最后得到复性蛋白成品。

上述的用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法,其中,步骤S1中,所述洗涤液包括50mM Tris、100mM NaCl、1mM EDTA、2%Triton-100和2M尿素,且pH为8.0,所述细胞破碎液包括20mM磷酸盐和500mM NaCl,且pH为7.4。

上述的用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法,其中,步骤S2中,所述变性剂包括6M盐酸胍、50mM Tris、100mM NaCl、10mM EDTA、10mM DTT和10%甘油,且pH为8.0。变性剂的主要成分6M盐酸胍结合DTT二硫苏糖醇还原剂以溶解包涵体,本发明使用6M盐酸胍使得蛋白中的氢键断裂,增加非极性分子包括氨基酸侧链的溶解度。加入10mM DTT二硫苏糖醇还原剂,彻底使得破坏二硫键,使得变性更彻底。并加入10%甘油稳定蛋白结构,促进正确结构的生成。

上述的用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法,其中,步骤S3中,所述复性液包括100mM Tris、400mM精氨酸、2mM EDTA、5mM GSH和0.5mM GSSG,且pH为8.0。为提高复性效率,本发明通过实验采用GSH:GSSG氧化交换系统的浓度比例控制在10:1。同时在复性液中加入100mM Tris提高包涵体蛋白的折叠效率;加入400mM精氨酸增加复性中间产物溶解度;加入2mM EDTA金属螯合剂,螯合铜离子和铁离子防止已还原的巯基发生氧化反应。

复性的最佳时间为24-36小时,本发明经过多重实验,复性时间定为24h。

通常复性液中含有盐酸胍,蛋白难以长期储存,本发明提出将复性后的蛋白置换到所需的环境之中。而将复性蛋白置换又是变复性的另一大挑战,蛋白极易损失,本发明经过优化将蛋白得率控制在30%以上。

本发明变复性方法适用于大肠杆菌表达得到的曲妥珠单链抗体蛋白,同时也适用于与曲妥珠单链抗体蛋白序列同源性达到60%以上的单链抗体蛋白。本发明考虑到蛋白复性的复杂性,且考虑到复性液并非最后蛋白的环境,提出了一种最佳置换方法,即本发明方法制得的复性单链抗体重组蛋白溶液,该单链抗体重组蛋白所处的溶剂即为使用者后续实验所需的缓冲液,无需再进行缓冲液的置换,同时最终产物中单链抗体蛋白的浓度能达到30mg/mL以上,单链抗体复性率达到20%以上,最终置换蛋白与复性单链抗体蛋白的比例达到30%以上。

附图说明

图1是实施例1中曲妥珠单链抗体4HKZ重组蛋白先变复性再置换过程中蛋白的非还原SDS-PAGE检测结果;

图2是实施例2中人类抗干扰素单抗3UX9重组蛋白先变复性再置换过程中蛋白的非还原SDS-PAGE检测结果;

图3是实施例3中易普利姆玛单抗5XJ3重组蛋白先变复性再置换过程中蛋白的非还原SDS-PAGE检测结果。

具体实施方式

下面结合具体实施例对本发明作进一步的说明,但并不局限于此。下述实施例中所述试剂原料除非注明来源外,均为市售的常见原料,试剂的配制采用常规方法。实施例中未详述的方法均为本领域常规操作。

本实施例中所采用的曲妥珠单链抗体,在PDB蛋白质结构数据库中名称为4HKZ,其氨基酸序列如SEQ.NO.1所示,同时以4HKZ序列为模板按照同源性60%以上在PDB蛋白质结构数据库进行单链抗体的搜索,搜索得到人类抗干扰素单链抗体3UX9,氨基酸序列如SEQ.NO.2所示,以及易普利姆玛单链抗体5XJ3,氨基酸序列如SEQ.NO.3所示。

将曲妥珠单链抗体4HKZ(以下称为单链抗体4HKZ)、人类抗干扰素单链抗体3UX9(以下称为单链抗体3UX9)以及易普利姆玛单链抗体5XJ3(以下称为单链抗体5XJ3)分别通过大肠杆菌表达系统诱导表达,经细胞破碎、离心后制备得到单链抗体重组蛋白包涵体。

实施例1

将湿菌重量为6g的单链抗体4HKZ破碎、离心,得到单链抗体4HKZ重组蛋白包涵体,该重组蛋白包涵体的变复性方法包括以下步骤:

步骤S1:将单链抗体4HKZ重组蛋白包涵体用洗涤液进行洗涤并离心,得到的沉淀再用细胞破碎液洗涤、离心重复三次,得到沉淀为纯化的单链抗体4HKZ重组蛋白包涵体;其中,洗涤液包括50mM Tris、100mM NaCl、1mM EDTA、2%Triton-100和2M尿素,且pH为8.0,所述细胞破碎液包括20mM磷酸盐和500mM NaCl,且pH为7.4;

步骤S2:将步骤S1得到3.8g的纯化的单链抗体4HKZ重组蛋白包涵体用19mL变性剂彻底溶解,对变性的重组蛋白溶液进行搅拌,搅拌速度为100-150rpm,搅拌温度为4℃,搅拌时间为12小时,搅拌后离心取上清液,得到变性蛋白液,并将其蛋白浓度调整为30mg/mL,经检测得变性后的蛋白含量为570mg;其中,变性剂包括6M盐酸胍、50mM Tris、100mM NaCl、10mM EDTA、10mM DTT和10%甘油,且pH为8.0。

步骤S3:取9mL变性蛋白液平均分为三剂,每剂之间间隔两小时,缓慢滴入1L的复性液中,滴加完毕后在100-150rpm、4℃条件下搅拌24小时,得到复性蛋白液;其中,复性液包括100mM Tris、400mM精氨酸、2mM EDTA、5mM GSH和0.5mM GSSG,且pH为8.0。

步骤S4:将步骤S3制得的复性蛋白液离心,上清液经4℃冰浴后抽滤去除沉淀,得到的蛋白溶液通过超滤膜包浓缩至20mL,再次离心后取上清得到浓缩复性蛋白溶液,经检测,蛋白含量为128mg;

步骤S5:将步骤S4制得的浓缩复性蛋白溶液按照1:6的体积比缓慢倒入蛋白复性后实验所需的缓冲液中,4℃环境下搅拌12小时,经过离心和抽滤去除沉淀后,得到置换后的蛋白溶液,经检测,蛋白含量为48mg;

步骤S6:将步骤S5制得的置换后的蛋白溶液的蛋白浓度浓缩至8mg/mL,通过分子筛进行纯化分离,最后得到复性蛋白成品。

本实施例变复性方法的蛋白复性率为22.4%,置换缓冲液后的蛋白含量占复性后蛋白含量的占比为37.5%。

图1为本实施例中曲妥珠单链抗体4HKZ重组蛋白先变复性再置换过程中蛋白的非还原SDS-PAGE检测结果。如图1所示,M为蛋白Marker,13为步骤S6中复性置换后得到的浓缩蛋白,从图上可以看到仍存在部分杂质,而1-12为13泳道的蛋白溶液经过分子筛纯化后的蛋白结果。

实施例2

将湿菌重量为9.2g的单链抗体3UX9破碎、离心,得到单链抗体3UX9重组蛋白包涵体,该重组蛋白包涵体的变复性方法包括以下步骤:

步骤S1:将单链抗体3UX9重组蛋白包涵体用洗涤液进行洗涤并离心,得到的沉淀再用细胞破碎液洗涤、离心重复三次,得到沉淀为纯化的单链抗体3UX9重组蛋白包涵体;其中,洗涤液包括50mM Tris、100mM NaCl、1mM EDTA、2%Triton-100和2M尿素,且pH为8.0,所述细胞破碎液包括20mM磷酸盐和500mM NaCl,且pH为7.4;

步骤S2:将步骤S1得到4g的纯化的单链抗体3UX9重组蛋白包涵体用20mL变性剂彻底溶解,对变性的重组蛋白溶液进行搅拌,搅拌速度为100-150rpm,搅拌温度为4℃,搅拌时间为12小时,搅拌后离心取上清液,得到变性蛋白液,并将其蛋白浓度调整为30mg/mL,经检测得变性后的蛋白含量为608mg;其中,变性剂包括6M盐酸胍、50mM Tris、100mM NaCl、10mMEDTA、10mM DTT和10%甘油,且pH为8.0。

步骤S3:取9mL变性蛋白液平均分为三剂,每剂之间间隔两小时,缓慢滴入1L的复性液中,滴加完毕后在100-150rpm、4℃条件下搅拌24小时,得到复性蛋白液;其中,复性液包括100mM Tris、400mM精氨酸、2mM EDTA、5mM GSH和0.5mM GSSG,且pH为8.0。

步骤S4:将步骤S3制得的复性蛋白液离心,上清液经4℃冰浴后抽滤去除沉淀,得到的蛋白溶液通过超滤膜包浓缩至20mL,再次离心后取上清得到浓缩复性蛋白溶液,经检测,蛋白含量为144mg;

步骤S5:将步骤S4制得的浓缩复性蛋白溶液按照1:6的体积比缓慢倒入蛋白复性后实验所需的缓冲液中,4℃环境下搅拌12小时,经过离心和抽滤去除沉淀后,得到置换后的蛋白溶液,经检测,蛋白含量为47mg;

步骤S6:将步骤S5制得的置换后的蛋白溶液的蛋白浓度浓缩至8mg/mL,通过分子筛进行纯化分离,最后得到复性蛋白成品。

本实施例变复性方法的蛋白复性率为23.7%,置换缓冲液后的蛋白含量占复性后蛋白含量的占比为32.6%。

图2为本实施例中人类抗干扰素单链抗体3UX9重组蛋白先变复性再置换过程中蛋白的非还原SDS-PAGE检测结果。如图2所示,M为蛋白Marker,13为步骤S6中复性置换后得到的浓缩蛋白,从图上可以看到仍存在部分杂质,而1-12为13泳道的蛋白溶液经过分子筛纯化后的蛋白结果。

实施例3

将湿菌重量为13.2g的单链抗体5XJ3破碎、离心,得到单链抗体5XJ3重组蛋白包涵体,该重组蛋白包涵体的变复性方法包括以下步骤:

步骤S1:将单链抗体5XJ3重组蛋白包涵体用洗涤液进行洗涤并离心,得到的沉淀再用细胞破碎液洗涤、离心重复三次,得到沉淀为纯化的单链抗体5XJ3重组蛋白包涵体;其中,洗涤液包括50mM Tris、100mM NaCl、1mM EDTA、2%Triton-100和2M尿素,且pH为8.0,所述细胞破碎液包括20mM磷酸盐和500mM NaCl,且pH为7.4;

步骤S2:将步骤S1得到4g的纯化的单链抗体5XJ3重组蛋白包涵体用20mL变性剂彻底溶解,对变性的重组蛋白溶液进行搅拌,搅拌速度为100-150rpm,搅拌温度为4℃,搅拌时间为12小时,搅拌后离心取上清液,得到变性蛋白液,并将其蛋白浓度调整为30mg/mL,经检测得变性后的蛋白含量为466mg;其中,变性剂包括6M盐酸胍、50mM Tris、100mM NaCl、10mMEDTA、10mM DTT和10%甘油,且pH为8.0。

步骤S3:取9mL变性蛋白液平均分为三剂,每剂之间间隔两小时,缓慢滴入1L的复性液中,滴加完毕后在100-150rpm、4℃条件下搅拌24小时,得到复性蛋白液;其中,复性液包括100mM Tris、400mM精氨酸、2mM EDTA、5mM GSH和0.5mM GSSG,且pH为8.0。

步骤S4:将步骤S3制得的复性蛋白液离心,上清液经4℃冰浴后抽滤去除沉淀,得到的蛋白溶液通过超滤膜包浓缩至20mL,再次离心后取上清得到浓缩复性蛋白溶液,经检测,蛋白含量为99mg;

步骤S5:将步骤S4制得的浓缩复性蛋白溶液按照1:6的体积比缓慢倒入蛋白复性后实验所需的缓冲液中,4℃环境下搅拌12小时,经过离心和抽滤去除沉淀后,得到置换后的蛋白溶液,经检测,蛋白含量为34mg;

步骤S6:将步骤S5制得的置换后的蛋白溶液的蛋白浓度浓缩至8mg/mL,通过分子筛进行纯化分离,最后得到复性蛋白成品。

本实施例变复性方法的蛋白复性率为21.2%,置换缓冲液后的蛋白含量占复性后蛋白含量的占比为34.3%。

图3为本实施例中易普利姆玛单链抗体5XJ3重组蛋白先变复性再置换过程中蛋白的非还原SDS-PAGE检测结果。如图3所示,M为蛋白Marker,1为复性置换后的蛋白经过分子筛纯化后的蛋白结果。

通过实施例1至3的实验结果可见:本发明变复性方法适用于大肠杆菌表达得到的曲妥珠单链抗体4HKZ,同时也适用于与曲妥珠单链抗体同源性达到60%以上的单链抗体,即人类抗干扰素单链抗体3UX9和易普利姆玛单链抗体5XJ3。

本发明考虑到蛋白复性的复杂性,且考虑到复性液并非最后蛋白的环境,提出了一种最佳置换方法,即本发明方法制得的复性单链抗体重组蛋白溶液,该单链抗体重组蛋白所处的溶剂即为使用者后续实验所需的缓冲液,无需再进行缓冲液的置换,同时最终产物中单链抗体蛋白的浓度能达到30mg/mL以上,单链抗体复性率达到20%以上,最终置换蛋白与复性单链抗体蛋白的比例达到30%以上。

以上实施例仅供说明本发明之用,而非对本发明的限制,有关技术领域的技术人员,在不脱离本发明的精神和范围的情况下,还可以作出各种变换或变型,因此所有等同的技术方案也应该属于本发明的范畴,应由各权利要求所限定。

SEQUENCE LISTING

<110> 华东师范大学

<120> 一种用于曲妥珠单链抗体及与其序列同源的单链抗体的变复性方法

<130> 1

<160> 3

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 228

<212> PRT

<213> 人工合成

<400> 1

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

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20 25 30

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35 40 45

Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

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210 215 220

Thr Val Ser Ser

225

<210> 2

<211> 228

<212> PRT

<213> 人工合成

<400> 2

Ile Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Gly Ala Pro Gly Gln Arg

1 5 10 15

Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Tyr

20 25 30

Val Ser Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Asp Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Thr Gly Leu Gln Ser

65 70 75 80

Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Arg Asp Asn Asn Glu Asn

85 90 95

Glu Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Glu Val Gln

100 105 110

Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg

115 120 125

Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser

130 135 140

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165 170 175

Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met

180 185 190

Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Tyr

195 200 205

Ile Asp Phe Gly Asp His Met Asp Phe Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val

210 215 220

Thr Val Ser Ser

225

<210> 3

<211> 227

<212> PRT

<213> 人工合成

<400> 3

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly

1 5 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Gly Ser Ser

20 25 30

Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu

35 40 45

Ile Tyr Gly Ala Phe Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser

50 55 60

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65 70 75 80

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85 90 95

Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Gln Val Gln

100 105 110

Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg

115 120 125

Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Thr Met His

130 135 140

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145 150 155 160

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165 170 175

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180 185 190

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195 200 205

Gly Trp Leu Gly Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr

210 215 220

Val Ser Ser

225

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