用于鉴定和验证共有候选抗原和共有抗原特异性T淋巴细胞对的方法和系统

摘要

本发明涉及用于鉴定和验证候选抗原及其同类抗原特异性T淋巴细胞对的方法和系统，其可用于验证配对的抗原和TCR序列的免疫原性活性。本方法包括确定与参照样品相比在获得自患者组的样品中转录更高的一种或多种剪接变体，确定存在于所述一种或多种剪接变体的氨基酸翻译中但不存在于参照样品的相应剪接变体的氨基酸翻译中的一种或多种氨基酸序列，并预测氨基酸序列的HLA结合以鉴定候选的共有抗原的步骤等。本发明还涉及表征和/或治疗包括癌症在内的医学病况的方法。