本发明涉及一种鉴别杜长大三元猪和长大二元猪的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记位于猪6号染色体上的MC1R基因的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体181697bp处含rs45435032核苷酸位点的分子标记,且具有T/C多态性,所述SNP标记在杜长大三元猪和长大二元猪群体间有差异基因型,其中杜长大三元猪为TC基因型,长大二元猪为CC基因型。一种用于检测所述的SNP标记的引物对,上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。通过鉴定该SNP标记基因型来简易、高效地鉴别杜长大三元猪和长大二元猪。
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