一种基于带权多粒度扫描的转录因子结合位点预测方法

摘要

本发明公开了一种基于带权多粒度扫描的转录因子结合位点预测方法，该方法属于位点预测领域。该方法包含如下步骤：利用逆序列、互补序列和互补逆序列对初始数据集进行増广；使用独热编码和多碱基特征编码结合对DNA序列进行特征表示；划分训练集和测试集；计算特征的权重向量；进行带权的多粒度扫描；通过级联森林进行模型的训练得到转录因子结合位点分类预测模型；将测试集输入到该分类预测模型中，得到分类预测结果；构建评价指标对方法的性能进行评估。该方法克服了现有方法只注重单一碱基特征、训练耗时长、预测精度不高等问题，具有高度的鲁棒性和可移植性。