构建任意分辨率粗粒化模型的方法

摘要

本发明属于分子动力学模拟领域，具体涉及一种构建任意分辨率粗粒化模型的方法。具体包括：一种可由用户任意定义分辨率的粗粒化模型；该粗粒化模型由成键粒子和非键粒子构成；该粗粒化模型中各粒子的键联关系方式；该粗粒化模型中各粒子参数的拟合方法；该粗粒化模型与全原子模型映射关系的拟合方法。本发明为用户提供一种可以根据模拟需求自定义粗粒化模型分辨率的方法，以便用户自主调节模拟精度与效率的关系。此模型模拟效率比全原子模型快至少100倍，且保证了相对较高的模拟精度。本发明主要适用于研究分子识别、组装的动力学过程及其机理，在生命科学、生物制药等领域具有广阔的应用前景。