一种基于上下文感知计算的RNA溶剂可及性预测方法

摘要

本发明公开了一种基于上下文感知计算的RNA溶剂可及性预测方法，包括：S1.收集PDB数据库中所有已注释三级结构信息的RNA序列组成训练集合S；S2.获取训练集合S中碱基个数为LX的RNA序列信息，并将获取的RNA序列信息记作SX；S3.搜索SX的核苷酸数据库并生成对应的MSA；S4.对MSA进行处理，生成MSA对应的FMSA；S5.根据独热编码原理将碱基编码生成SX对应的OHE；S6.生成SX对应的RSS；S7.构建上下文感知计算神经网络框架MVCADNN，并使用MVCADNN训练RNA溶剂可及性预测模型，得到训练后的RNA溶剂可及性预测模型；S8.将待预测RNA序列通过步骤S3‑步骤S6处理后，生成RNA序列对应的特征信息，并生成的特征信息输入到训练后的RNA溶剂可及性预测模型中，得到RNA溶剂可及性的预测信息。