SARS-CoV2潜在突变位点的筛选方法及其应用

摘要

本发明涉及生物信息学和生物医药技术领域，尤其是SARS‑CoV2潜在突变位点的筛选方法，包括：1）下载得到SARS‑CoV2的基因序列，对下载的序列进行快速注释文件和序列比对，从全基因组序列中提取出所有编码基因的序列；2）计算出每个位点的突变频率，筛选出高频率的突变热点，再结合毒株的采样时间和地理分布信息，筛选出在种群中具有显著选择优势的突变位点；3）下载已有的编码基因对应蛋白质的三级结构信息；4）根据预测的B细胞和T细胞表位，筛选位于免疫表位上或其附近的突变位点，评估其对宿主免疫反应的可能影响，鉴定出SARS‑CoV‑2在流行传播中基因组上潜在的可能和病毒感染及宿主适应相关的关键变异位点。