一种基于远程同源模板的蛋白质结构建模方法

摘要

一种基于远程同源模板的蛋白质结构建模方法，基于多序列比对的思想，从局部比对出发，通过搜索蛋白质数据库发现若干个局部匹配；其次根据得到的局部匹配向两边扩展得到高得分的片段，然后通过多序列比对构建序列谱，再将序列谱重新带入数据库中搜索，迭代上述过程直至不再产生新的模板；最后得到满足期望阈值的模板，将得到的模板放入RosettaCM中进行同源建模结构预测。本发明提供一种能够有效辅助蛋白质结构预测的远程同源模板的蛋白质结构建模方法，能够提高蛋白质结构预测的精度。