一种基于自动视觉检测的单细胞孔板测序中鉴定细胞个数的新方法及系统

摘要

本发明提供了一种基于自动视觉检测的单细胞孔板测序中鉴定细胞个数的新方法及系统。该方法包括：首先读入孔板中的细胞显微拍照彩色图像，并将所述彩色图像转换为灰度图像；然后使用形态学滤波之Tophat滤波和Bottomhat滤波对图像进行增强；接着利用高斯滤波对增强后的细胞图像进行去噪处理；再使用Otsu算法，对处理后的图像进行分割，得到细胞目标；利用细胞目标的最小外接矩形计算目标的形状因子，根据形状因子进行合格细胞的鉴定；最后对图像中的合格细胞进行统计，当合格细胞数为1时，判定为合格的单细胞图像。本发明能够快速准确地判断单细胞孔板测序中某孔板下是否为单细胞。