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一种适用于Sequel测序的三代全长转录组测序结果分析方法

摘要

本发明公开了一种适用于Sequel测序平台的三代全长转录组分析方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一,测序数据过滤步骤;步骤二,测序数据比对步骤;步骤三,转录本注释步骤;步骤四,ORF预测步骤;步骤五,转录本功能注释步骤;步骤六,融合基因分析步骤;步骤七,LncRNA预测步骤;步骤八,可变剪切分析步骤;步骤九,可变多聚腺苷酸化分析步骤。本发明的运行速度更快,且与常用的matchannot软件相比对转录本的注释更加精细,更加便于分析转录本的类型。

著录项

  • 公开/公告号CN112086128A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-12-15

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南京派森诺基因科技有限公司;

    申请/专利号CN202010823703.X

  • 发明设计人 沈立;姜丽荣;孙子奎;

    申请日2020-08-14

  • 分类号G16B20/30(20190101);G16B50/00(20190101);

  • 代理机构31224 上海天翔知识产权代理有限公司;

  • 代理人吕楚姗

  • 地址 211800 江苏省南京市江北新区浦滨路211号扬子科创中心A栋24层2401室

  • 入库时间 2023-06-19 09:12:09

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