一种微卫星不稳定性的分析方法和分析装置

摘要

本发明提供了一种微卫星不稳定性的分析方法和分析装置，所述方法包括：对筛选的每一个微卫星不稳定标志物构建序列列表；获得肿瘤样本比对文件和健康样本比对文件；分别将肿瘤样本比对文件和健康样本比对文件的每对读长与微卫星位点标志物的2～3kb范围内的序列进行比对，获取覆盖微卫星位点标志物的总读取数；分别将肿瘤样本比对文件和健康样本比对文件的每对读长与微卫星位点标志物的序列列表进行比对，获取覆盖序列列表Lmi的总读取数；根据读取占比分布计算肿瘤样本和健康样本的KL散度和JS散度。本发明的方法基于健壮的JS散度方法比较肿瘤样本和健康样本之间的读取长度分布，准确地进行MSI检测。