一种基于局部有偏的蛋白质结构预测方法

摘要

本发明属于生物信息学、智能优化、计算机应用领域，公开了一种基于局部有偏的蛋白质结构预测方法。本发明包括步骤：计算目标个体变异窗口片段与片段库片段的疏水尺度差以及片段库中各片段的二级结构得分；对片段库中各片段统计并排序；选择最佳片段进行片段组装，通过蒙特卡洛机制判断是否接收以确定变异个体；计算变异个体与随机个体交叉片段的二级结构得分以确定交叉个体；通过随机数取值决定比较目标个体和交叉个体能量值或二级结构分数来选择下一代目标个体。本发明避免了传统构象空间优化方法的不足，如：采样效率低，预测精度较低。本发明借助于氨基酸疏水特性及其局部结构特征，实现了改进的结构模型评分方法。