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一种定义功能子通路扰动程度的方法

摘要

本发明公开了一种定义功能子通路扰动程度的方法,其特点是:所述功能子通路是指信号通路中,能够将上游信号传递到一个具体的生物功能节点的所有基因构成的路径,定义功能子通路的扰动程度的方法包括如下步骤:①构建一个通路中所有特定功能子通路;②确定相关的差异基因;③将所述差异基因映射到每个功能子通路,并利用超几何检验确定差异基因的显著性p值;④计算每个功能子通路的扰动程度;⑤计算所有子通路中对于特定功能f的扰动程度。本发明提出了功能扰动程度的概念,并提出了量化了功能子通路及功能的扰动程度的方法。在此基础上,对研究各种功能不平衡与疾病的关系起到重要作用。

著录项

  • 公开/公告号CN109063415A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-12-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 温州大学;

    申请/专利号CN201810588800.8

  • 发明设计人 刘文斌;鮑振申;昝乡镇;沈良忠;

    申请日2018-06-08

  • 分类号

  • 代理机构温州名创知识产权代理有限公司;

  • 代理人陈加利

  • 地址 325000 浙江省温州市瓯海区东方南路38号温州市国家大学科技园孵化器

  • 入库时间 2023-06-19 07:52:37

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-01-15

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/20 申请日:20180608

    实质审查的生效

  • 2018-12-21

    公开

    公开

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