一种基因组二代序列组装方法和系统

摘要

本发明公开了一种基因组二代序列组装方法和系统，所述方法包括：将样品基因组DNA打断至第一预定长度范围；对打断的DNA片段选择第二预定长度范围；对第二预定长度范围的DNA片段进行双末端测序，得到具有重叠的第一读长序列和第二读长序列；对第一读长序列和第二读长序列进行拼接，获得各个文库拼接后的序列；对各个文库拼接后的序列进行序列组装以获得基因组重叠群序列；根据读间对关系建立重叠群序列间的相对位置和方向关系，从而形成骨架序列；以及对骨架序列中无效碱基进行补洞填充。本发明的方法通过实验建库和测序读长选取，并结合拼接以实现延长序列读长，最后用延长后的序列进行组装，得到重叠群，能够提高基因组重叠群组装的指标和准确性。