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一种原核蛋白质乙酰化位点的预测方法

摘要

本发明公开了一种原核蛋白质乙酰化位点的预测方法,包括步骤:收集数据;数据处理;特征编码:特征训练;构建预测模型。本发明还公开了一种原核蛋白质乙酰化位点的预测方法的应用。本发明方法基于蛋白一级结构信息、物理化学信息和进化信息的多维特征编码,提取原核生物蛋白质乙酰化序列的特征,运用弹性网络Elastic Net优化和筛选最优特征向量,结合支持向量机SVM构建原核乙酰化位点的预测模型,显著提高预测模型对原核乙酰化位点的预测性能;开发的预测软件平台ProAcePred实现了对原核蛋白质乙酰化位点的高通量预测,为蛋白质乙酰化研究提供准确、简便和快速的研究工具,并为进一步的实验研究提供有价值的参考信息。

著录项

  • 公开/公告号CN107463802A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-12-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南昌大学;

    申请/专利号CN201710654001.1

  • 发明设计人 施绍萍;陈国东;曹曼;

    申请日2017-08-02

  • 分类号G06F19/28(20110101);G06F19/18(20110101);G06K9/62(20060101);

  • 代理机构36123 南昌青远专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人刘爱芳

  • 地址 330000 江西省南昌市红谷滩新区学府大道999号

  • 入库时间 2023-06-19 04:05:17

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-01-05

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/28 申请日:20170802

    实质审查的生效

  • 2017-12-12

    公开

    公开

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