辣椒和番茄细菌性疮痂病菌MLST分子分型方法

摘要

本发明公开了一种辣椒和番茄细菌性疮痂病菌分子分型的方法，首次公开了采用多位点序列分型方法（MLST），对辣椒和番茄细菌性疮痂病菌进行分子分型的操作技术，本发明提取该病原菌基因组DNA，通过7个看家基因筛选、扩增、检测与测序。采用DNAMAN软件对测序结果进行多序列比对与分析，获得菌株序列型（ST）。在线采用eBURST V3程序进行序列型分析，可将4种病原菌有效区分。本分型技术所使用的7个看家基因组合、扩增引物均为首次采用，PCR反应体系和条件为自行优化。该技术流程可以用于辣椒和番茄细菌性疮痂病菌分类鉴定和遗传多样性研究。