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云环境下基于编辑距离的相似碱基序列查询方法

摘要

本发明公开了一种云环境下基于编辑距离的相似碱基序列查询方法,主要解决云不完全可信时,从云端大量的电子记录中找出相似碱基序列的问题。其实现步骤为:(1)计算用户碱基序列的单字符操作集;(2)聚类;(3)用户碱基序列和聚类中心的哈希映射;(4)计算待查询碱基序列的单字符操作集;(5)待查询序列的哈希映射;(6)选择候选客户端;(7)查找相似碱基序列。本发明是将基于编辑距离的相似碱基序列查询方法应用于云环境下,较之传统的相似碱基序列查询方法,具有较好的扩展性和伸缩性,保证云环境下的碱基序列的安全,减少硬件资源的消耗。

著录项

  • 公开/公告号CN105956417A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2016-09-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 西安电子科技大学;

    申请/专利号CN201610289866.8

  • 发明设计人 张世哲;李辉;马建峰;马鑫迪;

    申请日2016-05-04

  • 分类号

  • 代理机构陕西电子工业专利中心;

  • 代理人田文英

  • 地址 710071 陕西省西安市太白南路2号

  • 入库时间 2023-06-19 00:30:14

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-08-13

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G06F19/22 申请公布日:20160921 申请日:20160504

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2016-10-19

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/22 申请日:20160504

    实质审查的生效

  • 2016-09-21

    公开

    公开

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