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特异性DNA假结结构修饰的金电极及制备方法和应用

摘要

本发明属于电化学传感器技术领域,具体涉及一种特异性DNA假结结构修饰的金电极及制备方法和应用。本发明所述特异性DNA假结结构修饰的金电极表面通过金‑巯键的作用自组装修饰有末端带亚甲蓝氧化还原标签、茎环1含Nanog结合序列的DNA假结结构,该生物传感器利用功能化的DNA假结结构探针修饰的金电极与目标蛋白反应后,引起DNA假结结构构象改变,借助具有良好导电性的电信号分子MB,实现了对转录因子Nanog的灵敏检测,可以有效区分靶蛋白与其他对照蛋白。本方法操作简单,具有较高灵敏性和特异性,最小检测范围是170pM。

著录项

  • 公开/公告号CN105929001A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2016-09-07

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南京大学;

    申请/专利号CN201610243290.1

  • 发明设计人 李根喜;马洁桦;李超;陶雅沁;

    申请日2016-04-19

  • 分类号G01N27/327(20060101);G01N27/48(20060101);

  • 代理机构32207 南京知识律师事务所;

  • 代理人胡锡瑜

  • 地址 210093 江苏省南京市栖霞区仙林大道163号

  • 入库时间 2023-06-19 00:28:54

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-04-10

    授权

    授权

  • 2016-10-05

    实质审查的生效 IPC(主分类):G01N27/327 申请日:20160419

    实质审查的生效

  • 2016-09-07

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于电化学传感器技术领域,具体涉及一种特异性DNA假结结构修饰的金电极及制备方法和应用。

背景技术

细胞生物学的最有趣的问题之一是细胞多能性,细胞多能性受到严格的监管,调节异常可能会导致先天性缺陷、无法损伤修复甚至是癌症。Nanog是多能性相关的重要转录因子(transcription factors,TFs)之一,是一个近期引起大家极大兴趣的生物分子,它发挥功能是通过调控细胞增殖、死亡,决定细胞命运。已知,Nanog在大部分正常成年组织中不表达,但是高表达于胚胎干细胞和肿瘤细胞。研究已经揭示了Nanog在肿瘤中对于肿瘤细胞的干细胞样表型做出了贡献。升高的Nanog水平通常与肿瘤发生、细胞侵袭和转移有关。Nanog的强烈高表达通常预示了癌症恶性程度高、抗药性以及不良结局。因此,检测Nanog对于肿瘤评估、药物干预检测及临床预后具有重要意义。

传统的TF检测方法有如下几种:浓度检测(例如:western blots,immunohistochemistry or ELISA),绑定活性检测(例如:electrophoresis mobility shift assay,ChIP)和转录水平检测(例如:qPCR)。这些方法各有优点,但是也存在着耗时长、操作复杂,测定结果容易出现假阴性等弊端。近年来,电化学技术不断发展,在生命科学领域发挥了十分重要的作用。电化学DNA(E-DNA)传感器具有操作简单、灵敏性高、成本低廉等优势。目前,研究人员已发展了一些检测TF的E-DNA传感器,他们都具有相当的灵敏性和特异性,给TF检测提供了潜在的替换方法。但是这些方法尽管具有这些优势,他们在实际应用中仍然存在一些缺陷。例如,大部分报道的E-DNA体系是signal-off型,signal-off的体系结构容易出现假阳性(例如探针降解)和相对小的检测范围。相反,signal-on型传感器则能够降低背景信号,具有明显优势。因此,近期有研究投入到了开发signal-on的TF电化学传感器。然而这些方法仍然存在DNA链设计复杂、结合效率低等不足。

发明内容

本发明需要解决的问题是提供一种特异性DNA假结结构修饰的金电极及其制备方法和对Nanog的定量检测。

为了达到解决上述问题的目的,本发明采用如下机理:DNA假结结构包含两个茎环结构(茎环1和2),茎环1形成了茎环2的一部分。DNA假结结构序列为:ttttgaccga ttatgtttag atcagttcat aatcggtctt tttttttttt ttctgatct。DNA假结结构3′端修饰了亚甲蓝氧化还原标签,5′端通过金-巯键修饰到电极表面(图1)。茎环1设计了Nanog结合序列。因为DNA假结结构具有相对刚性的结构,减少了氧化还原探针和电极的接触,信号背景将最小化。Nanog绑定后,由于Nanog分子相对较大,存在位阻效应,将打断茎环2,释放一个弹性的单链信号链,从而加强了电子传递效率,增加感应电流。

本发明的技术方案:

本发明所述一种特异性DNA假结结构修饰的金电极的表面通过金-巯键的作用自组装修饰有末端带亚甲蓝氧化还原标签、茎环1含Nanog结合序列的DNA假结结构,该DNA假结结构序列为:ttttgaccga ttatgtttag atcagttcat aatcggtctt tttttttttt ttctgatct。

本发明所述特异性DNA假结结构修饰的金电极的制备方法由以下步骤构成:(1)将金电极(3.0mm直径)浸泡于水虎鱼溶液(H2SO4:30%H2O2=3:1)15分钟,以消除吸附的物质,并用超纯水漂洗;(2)分别用1μm和0.3μm的氧化铝打磨,并且依次在乙醇和超纯水中超声10分钟,用氮气吹干;(3)取水虎鱼溶液滴加到金电极表面反应5分钟,用超纯水冲洗干净,吹干;(4)将处理过的金电极置于0.5M>2SO4中,在0~1.6V电压范围内进行伏安扫描,扫速为100mV/s,直至达到稳定;(5)金电极用超纯水冲洗并吹干后,浸没在含DNA假结结构的电极修饰溶液中,室温下孵育1.5h,再浸没在1mM巯基乙醇溶液中1h,用超纯水冲洗,吹干,即得到DNA假结结构修饰的金电极。上述含DNA假结结构的电极修饰溶液为10mM>2,5mM>

本发明所述特异性DNA假结结构修饰的金电极对转录因子Nanog的电化学检测方法,采用本发明所述特异性DNA假结结构修饰的金电极为工作电极,饱和甘汞电极为参比电极,铂电极为对电极,具体步骤为:

(1)取Nanog加入到10mM Tris–HCl,140mM NaCl,1mM MgCl2,and>

(2)将经步骤(1)处理的工作电极放置于10mM Tris–HCl,PH 7.0缓冲液中,利用三电极系统,以方波伏安法(SWV)检测,并在5~25nM范围内,得到电流与Nanog浓度的线性关系曲线,其线性系数为0.99;

(3)利用步骤(2)所得标准曲线法对待测样进行分析检测,分析Nanog的含量。

本发明的有益效果如下:

(1)本发明所述特异性DNA假结结构检测转录因子的金电极,其制作成本低廉、工艺简单、操作简易;

(2)本方法制备的电化学传感器能够成功检测转录因子Nanog,而且灵敏度、特异性高,具有很好的重复性;

(3)由于Nanog本身可以作为一种的检测靶标,用于细胞多能性分析、肿瘤耐药性及预后诊断,对疾病的临床检测提供技术支持,具有广泛的应用前景。

附图说明

图1为本发明的方法原理图。

图2为不同浓度0~45nM Nanog存在情况下电化学信号的变化图。其中内嵌图为蛋白浓度在5~25nM范围内与电化学信号变化值之间的线性关系图。

图3修饰有DNA假结结构底物的金电极分别与空白、25nM血红蛋白、BSA、NF-κB、Nanog反应1h的电化学信号。

具体实施方式

实施例一:利用特异性DNA假结结构修饰的金电极检测不同浓度Nanog。

步骤一,将金电极(3.0mm直径)浸泡于水虎鱼溶液(H2SO4:30%H2O2=3:1)15分钟,以消除吸附的物质,并用超纯水漂洗。接着,分别用1μm>

步骤二,将处理过的金电极置于0.5M>2SO4中,在0~1.6V电压范围内进行伏安扫描,扫速为100mV/s,直至达到稳定;金电极用超纯水冲洗并吹干后,浸没在含DNA假结结构的电极修饰溶液中,室温下孵育1.5h,再浸没在1mM巯基乙醇溶液中1h,用超纯水冲洗,吹干,即得到DNA假结结构修饰的金电极。

步骤三,取Nanog加入到10mM Tris–HCl,140mM NaCl,1mM MgCl2,and>

如图2所示,测得各溶液的峰电流随着Nanog浓度升高而升高,这是由于Nanog与DNA假结结构结合位点结合后,由于Nanog分子相对较大,绑定之后存在位阻效应,将打开茎环2,释放MB分子到电极表面,增强电信号。Nanog浓度在5–25nM与SWV峰值响应线性相关,最小检测范围是170pM,说明本发明的检测方法具有较高的灵敏性。

实施例二:生物传感器特异性研究。

为验证本发明检测Nanog的特异性,本发明用了不同的蛋白,如人血红蛋白,牛血清白蛋白(BSA)和转录因子NF-κB,按照实施例一的操作过程处理来验证该生物传感器的特异性。如图3所示,当没有Nanog或者用其他非特异蛋白替代时,则几乎没有峰值,只有当加入Nanog时,检测到明显峰信号。实验证实,此方法具有很好的特异性,本生物传感器检测具有高度选择性。

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