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一种基于基因序列表达分析的LncRNA发掘方法

摘要

本发明根据基因序列表达和基因预测算法,找到了一种可以直接预测并定量长非编码RNA的生物信息学方法,可直接针对长非编码RNA进行锁定,以便于进一步的实验验证。本发明主要包括如下流程:步骤1、收集人的所有全长mRNA序列数据;步骤2、去除包含编码蛋白的外含子的mRNA序列;步骤3、整理大于200bp的长非编码RNA,形成可检索数据库。步骤4、搜索已有基因表达序列分析数据,从中鉴定高表达的长非编码RNA。步骤5、实验验证。最终,我们预测了在特定细胞组织中高表达的长非编码RNA。

著录项

  • 公开/公告号CN102693369A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2012-09-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海聚类生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201110071945.9

  • 发明设计人 曾华宗;

    申请日2011-03-24

  • 分类号G06F19/20;

  • 代理机构

  • 代理人

  • 地址 200333 上海市祁连山南路999弄80号801室

  • 入库时间 2023-12-18 06:37:32

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2014-12-31

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G06F19/20 申请公布日:20120926 申请日:20110324

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2014-07-30

    文件的公告送达 IPC(主分类):G06F19/20 收件人:曾华宗 文件名称:视为撤回通知书 申请日:20110324

    文件的公告送达

  • 2012-09-26

    公开

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