通过利用可变聚类端点的聚类分析的CT确定

摘要

用于确定动态PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。可以在荧光强度(y轴)对周期数(x轴)的二维图中使PCR数据集可视化。对该数据集进行变换以产生具有包括在周期(n)时的荧光的一列和包括在周期(n+i)时的荧光的第二列的数据点分区表，其中i典型地为1或更大。利用所确定的聚类基于y(n+1)对n确定每一聚类的线性斜率，并针对每一聚类确定该聚类的斜率与邻近聚类的斜率的比率。然后比较比率。具有最大或最小比率的聚类的端点表示数据曲线中感兴趣的特定点。PCR曲线的表示肘值或Ct值的数据点被确定为所确定的聚类之一的端点，并且返回或显示对应于该数据点的周期数。