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基于多元熵距离法的微生物基因预测方法

摘要

本发明涉及微生物基因组序列分析、微生物基因识别、微生物物种识别等生物信息技术,包括以下步骤:a.设置部分已知编码的ORF和非编码的ORF,作为初始状态的聚类中心点;b.读取微生物DNA序列;c.从上述序列中找出所有最长的ORF,并记录它们在此序列中的位置;d.对该微生物DNA序列进行分析判别,将其分为编码序列、非编码序列和未定编码序列;e.将未定编码序列加入聚类中心点,重复步骤d,直到未定编码序列都归入到编码序列或者非编码序列;f.将分为编码序列的候选基因定为编码蛋白的基因。采用本发明地测试方法,可以方便准确地测试出基因组序列,与现有技术相比较,其测试精度明显提高,其测试方法简便易行。

著录项

  • 公开/公告号CN1566365A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2005-01-19

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京大学;

    申请/专利号CN03147763.1

  • 申请日2003-06-24

  • 分类号C12Q1/68;

  • 代理机构11127 北京三友知识产权代理有限公司;

  • 代理人李强

  • 地址 100871 北京市海淀区颐和园路5号

  • 入库时间 2023-12-17 15:51:36

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2007-02-07

    发明专利申请公布后的视为撤回

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2005-03-16

    实质审查的生效

    实质审查的生效

  • 2005-01-19

    公开

    公开

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