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一种构建异交物种高密度基因型图谱的方法

摘要

本发明公开了一种构建异交物种高密度基因型图谱的方法,包括:步骤1、对目标植物的亲本材料进行高覆盖测序,对目标植物的子代群体材料进行低覆盖测序,获得相应测序结果;步骤2:将亲子代群体测序获得的序列比对到目标植物的现有基因组上,并得到变异文件,所述变异文件中包含每个被测序材料测得的变异位点信息;步骤3:结合亲本材料的测序结果,对所有亲子代测序比对结果中的单核苷酸多态(SNP)位点进行筛选,将选出的SNP位点进行区段划分,并基于划分后各区段内基因片段的亲缘关系进行基因型分类;步骤4:对划分后的基因型进行单倍体类型统一和缺失基因型填充。

著录项

  • 公开/公告号CN111508560A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-08-07

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海师范大学;

    申请/专利号CN202010356410.5

  • 申请日2020-04-29

  • 分类号G16B30/00(20190101);G16B20/00(20190101);

  • 代理机构11457 北京律谱知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人黄云铎

  • 地址 200233 上海市徐汇区桂林路100号

  • 入库时间 2023-12-17 11:45:16

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-08-07

    公开

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