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一种高通量筛选真核生物细胞响应环境极端pH的靶点基因的方法

摘要

本发明涉及一种高通量筛选真核生物细胞响应环境极端pH的靶点基因的方法,首先构建真核生物CRISPR/Cas全基因组编辑载体文库,然后将该载体库稳定整合到真核生物细胞,构建真核生物全基因组编辑细胞文库。然后取该细胞文库,均匀的分成5部分,在不同的pH条件下培养,收集并且抽提基因组DNA,分别用高通量测序法检测各组细胞的sgRNA丰度,筛选真核生物细胞响应环境极端pH的靶点基因。本发明在全基因组范围内筛选真核生物响应环境极端pH的靶点基因,能够最大限度的筛选真核生物响应环境极端pH的靶点基因,成本低,效率高,范围广。对筛选真核生物响应环境极端pH的靶点基因和研究真核生物与环境互作具有极大地意义。

著录项

  • 公开/公告号CN111549061A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-08-18

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 西南大学;

    申请/专利号CN202010378947.1

  • 发明设计人 马三垣;常珈菘;夏庆友;

    申请日2020-05-07

  • 分类号C12N15/85(20060101);C12N15/90(20060101);C12Q1/6869(20180101);

  • 代理机构11275 北京同恒源知识产权代理有限公司;

  • 代理人赵荣之

  • 地址 400715 重庆市北碚区天生路2号

  • 入库时间 2023-12-17 11:07:24

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-08-18

    公开

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