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一种蛋白质异构体对相互作用预测方法及装置

摘要

本发明公开了一种蛋白质异构体对相互作用预测方法及装置,所述方法包括以下步骤,首先对于每个蛋白质异构体对,基于其在n个组织中的表达数据的皮尔逊相关系数分别确定其n个特征;然后获取蛋白质相互作用数据,其中包括具有相互作用的蛋白质对,对于这些蛋白质对,筛选出仅对应一个蛋白质异构体对的蛋白质对,令其对应的蛋白质异构体对的标签为1;利用随机采样方法产生不具有相互作用的蛋白质对,令其对应的所有蛋白质异构体对的标签为0;将确定了标签的蛋白质异构体对作为样本,基于样本数据训练预测模型;最后对于待分类的蛋白质异构体对,将其特征数据输入训练好的预测模型,得到其预测结果。本发明能够较准确的预测蛋白质相互作用关系。

著录项

  • 公开/公告号CN111370068A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-07-03

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中南大学;

    申请/专利号CN202010157694.5

  • 发明设计人 王建新;文骥威;李洪东;

    申请日2020-03-09

  • 分类号

  • 代理机构长沙市融智专利事务所(普通合伙);

  • 代理人杨萍

  • 地址 410083 湖南省长沙市岳麓区麓山南路932号

  • 入库时间 2023-12-17 10:20:40

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-07-28

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B40/00 申请日:20200309

    实质审查的生效

  • 2020-07-03

    公开

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