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一种满足生物约束的DNA信息存储编码方法

摘要

本发明公开了一种满足生物约束的DNA信息存储编码方法,步骤1、编码过程:生成某一码字长度下所有的序列,利用剪枝优化算法至少过滤掉不满足均聚物和G、C含量生物约束的序列,得到满足要求的所有码字及对应的二进制位数与理论存储密度,将各码字与二进制位的值一一对应生成码本;将存储文件的二进制流进行九位扫描,按照生成的码本将二进制位的值映射为相应码字,进行奇偶校验位,并将码字连接为150nt左右待合成的载体寡核苷酸链;步骤2、解码过程:扫描得到载体寡核苷酸链,去除奇偶校验位,连接为全长碱基序列,按照编码规则将碱基序列反映射为对应的二进制流。本发明较传统DNA信息随机存取方法具有较快的处理速度和较高的DNA信息存储密度。

著录项

  • 公开/公告号CN111243670A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-06-05

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 天津大学;

    申请/专利号CN202010076358.8

  • 发明设计人 张淑芳;黄贝贝;

    申请日2020-01-23

  • 分类号

  • 代理机构天津市北洋有限责任专利代理事务所;

  • 代理人李素兰

  • 地址 300072 天津市南开区卫津路92号

  • 入库时间 2023-12-17 10:03:51

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-06-30

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B25/00 申请日:20200123

    实质审查的生效

  • 2020-06-05

    公开

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