使用压缩的分子标记的核酸序列数据检测融合的方法

摘要

一种用于压缩核酸序列数据的方法，其中每个序列读数与分子标签序列相关，其中一部分序列读数比对对应于映射到靶向融合参考序列的序列读数，所述方法包括基于对应于序列读数家族的流动空间信号测量值确定每个序列读数家族的共有序列读数，确定每个序列读数家族的共有序列比对，其中所述共有序列比对的一部分对应于与所述靶向融合参考序列比对的共有序列读数，产生包含共有压缩数据的压缩数据结构，所述共有压缩数据包括每个家族的所述共有序列读数和所述共有序列比对，以及使用来自所述压缩数据结构的所述共有序列读数和所述共有序列比对，来检测融合。