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一种单细胞聚类方法、装置、电子设备及存储介质

摘要

本发明公开了一种单细胞聚类方法、装置、电子设备及存储介质。在计算节点对之间基于距离信息的局部相似性基础上,构建全局特征空间。基于全局特征空间,使用多核学习方法,计算节点对之间的全局相似性。然后,扩展考虑节点对的所有二阶路径上的节点,加入更多相关节点信息,构建更有效的全局相似性计算方法。最后,通过根据节点度大小对节点排序,决定节点初始加入社团顺序,从而改进Louvain社团检测方法,并使用该方法进行聚类。本发明简单有效,通过与其他方法比较,以及在公用单细胞转录组测序数据集上测试表明,该发明在单细胞转录组测序数据聚类方面有较好的预测性能。

著录项

  • 公开/公告号CN110827921A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-02-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 玉林师范学院;中南大学;

    申请/专利号CN201911097854.5

  • 申请日2019-11-12

  • 分类号

  • 代理机构长沙市融智专利事务所(普通合伙);

  • 代理人杨萍

  • 地址 537000 广西壮族自治区玉林市教育中路299号

  • 入库时间 2023-12-17 07:47:18

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-03-17

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B30/00 申请日:20191112

    实质审查的生效

  • 2020-02-21

    公开

    公开

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