检测细菌基因水平转移以及发生水平转移DNA片段的供体菌株的方法

摘要

本发明公开了检测细菌基因水平转移以及发生水平转移DNA片段的供体菌株的方法。本发明公开的方法包括将多个细菌以及待测细菌的基因组的测序数据切分为长度均为16nt的16‑mer，再将每个16‑mer均转换为0至232‑1之间的数字，排除待测细菌中的同种细菌的16‑mer获得待测菌株的特异16‑mer集合，比较待测菌株的特异16‑mer集合与多个细菌中出待测菌株外的16‑mer，确定共同16‑mer以及共同16‑mer的菌株，进而确定待测菌株是否发生了DNA水平转移以及发生水平转移DNA的供体菌株。本发明的方法操作快速简便，具有广泛的应用前景。