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一种药用植物共生微生物鉴定方法及其应用

摘要

本发明属于药用植物的生物信息学研究技术领域,特别涉及一种基于高通量测序,针对微生物16S rRNA基因的V3、V4区的生物信息学分析鉴定方法,包括如下步骤:采集样本,进行预处理操作;采用高通量测序的方法,获取样本中微生物16S rRNA基因的V3、V4区序列双链测序数据;借助FastQC软件筛选合格数据;借助Mothur软件对总链文件进行质控处理得到质控文件;借助Qiime软件对质控文件进行分析;借助R软件和LEfSe软件绘制可视化结果分析图表;对比结果,鉴别样本微生物。该方法通过可以快速鉴别样本微生物,从而可以进行中药材种植方式的鉴定和中药材具体作用机制的探究,进而为最大程度利用中药材的药效提供了可能,具有鉴别周期短、结果准确性高等特点。

著录项

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-02-25

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/689 申请日:20191106

    实质审查的生效

  • 2020-01-31

    公开

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