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水中病毒分离提取装置及水中札幌病毒的提取方法

摘要

水中病毒分离提取装置及水中札幌病毒的提取方法,属于水中病毒提取领域。本发明解决现有微生物过滤器存在容易漏气的技术问题,并提供了一种提取效率高、提取产物干扰少、提取产物适用于多种检测平台的水中札幌病毒提取方法。该装置存储罐设有穹顶,穹顶设有弧形缩口,顶盖底端设有外翻沿,顶盖由弧形缩口伸入并可通过密封圈卡在弧形缩口内,顶盖顶端对称设有耳座,耳座内装有杠杆,出水管穿过穹顶伸入到存储罐底部,进气管与氮气压力罐连接,出水管与过滤器连接,过滤器与滤膜支架连接。方法:水样过滤,用牛肉浸提物溶液洗脱,再等电点沉降法处理后离心,重溶后二次浓缩,再提取核酸;即完成了札幌病毒的提取。本发明用于分离提取水中病毒。

著录项

  • 公开/公告号CN103981084A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2014-08-13

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 黑龙江省科学院微生物研究所;

    申请/专利号CN201410234128.4

  • 申请日2014-05-29

  • 分类号C12M1/12;C12N7/02;C12N15/10;C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93;

  • 代理机构哈尔滨市伟晨专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人张伟

  • 地址 150010 黑龙江省哈尔滨市道里区兆麟街68号

  • 入库时间 2023-12-17 00:06:05

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2015-11-18

    授权

    授权

  • 2014-09-10

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12M1/12 申请日:20140529

    实质审查的生效

  • 2014-08-13

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于水中病毒提取领域;具体涉及水中病毒分离提取装置及利用 该装置提取水中札幌病毒的方法。

背景技术

水中的病毒对人体健康的风险日益受到关注,对环境水体中病毒的检测 是预防疾病、评估水源卫生质量、环境卫生状况的一项有价值的工作。

现有水中微生物过滤器的内胆与上盖的重合性不好,随压力增大,上盖 的密闭性降低,容易漏气。

病毒引起的胃肠疾病对人类有着极大的危害。札幌病毒(Sapovirus/SaV) 是引起急性腹泻的常见病毒,该病毒于1977年日本札幌地区肠道疾病暴发流 行过程中被发现,SaV属于杯状病毒家族,由单链RNA构成无衣壳结构, 在环境中可以稳定存在,能够引起人胃肠疾病,其拥有极低的感染剂量,在感 染后又具有极高的释放量(达到每克粪便样本1011个病毒颗粒)。

目前,已有报道的病毒的传播途径包括被污染的食物、水、人与人接触和 呕吐气浊物接触。相对于细菌来说,病毒更加难以灭活和消除。这些病毒通常 能够在各种水样中被监测到,如:污水,河水,地下水,海水甚至饮用水。由 这些水体中检测病毒的存在与否,关键环节在于如何由水中将病毒分离提取出 来。由于水中病毒的含量相对较低,且病毒颗粒较小,难以利用离心、过滤等 分离细菌的常规富集方法收集。由于设备和提取方法的限制,水体中病毒的提 取和检出费时费力。

发明内容

本发明要解决现有微生物过滤器存在容易漏气的技术问题;而提供一种 密封性好、过滤水中病毒效果好,易于拆卸组装,易于多次重复灭菌使用的 的水中病毒分离提取装置。

为解决上述技术问题,本发明的水中病毒分离提取装置包括氮气压力罐、 存储罐、过滤器和滤膜支架,所述的存储罐包括罐体和顶盖,罐体设有穹顶, 穹顶设有弧形缩口,顶盖底端设有外翻沿,密封圈置于外翻沿内,顶盖由弧 形缩口伸入并可通过密封圈卡在弧形缩口内,顶盖顶端对称设有耳座,耳座 内装有杠杆,杠杆包括一个“n”字形的提杆、两个弧形的连接杆及两个横折形 的支撑杆,所述提杆两端与连接杆通过过渡圆弧连接,连接杆的另一端与支 撑杆圆弧过渡连接,杠杆的支撑杆套在耳座内,支撑杆的底端可抵在穹顶上, 过渡圆弧可抵在穹顶上,穹顶上分别设有压力表、进气管和出水管,存储罐 的进气管与氮气压力罐连接,出水管底端穿过穹顶伸入到罐体底部,出水管 顶端设有控制阀,控制阀与过滤器通过两端连接快速接头的导管连接,过滤 器与滤膜支架通过两端连接快速接头的导管连接,滤膜支架设有放水管;所 述滤膜支架内设有正电荷滤膜。

出水管底端面与存储罐底部的距离为0.1~0.2mm,使分离水中病毒的效 果好,分离的彻底。

密封圈的截面为圆形或椭圆形,使密闭性更好。

本发明中顶盖通过杠杆将其由内向外卡在穹顶上,易于安装拆卸,并且 随着存储罐压力变大,顶盖与存储罐结合更加紧密,因此,密闭性就更好, 不易产生泄漏气体的现象。

本发明采用的过滤器通过快速接头与导管连接,可以根据不同水质需要 组合滤芯种类和滤器数量,降低水样水中杂质含量,降低滤膜因杂质干扰带 来的损耗影响。

存储罐即可采用消毒液浸泡灭菌也可采用高温高压灭菌,或采用两种方 法相结合灭菌,可以彻底消除二次污染对分子诊断学检测带来的影响。

本发明的装置结构简单,构思巧妙。

另外,本发明又提供了一种提取效率高、提取产物干扰少、提取产物适 用于多种检测平台的水中札幌病毒提取方法。

水中札幌病毒提取方法中利用上述的装置进行过滤、洗脱,具体提取方 法是按下述步骤进行的:

步骤一、将水样装入存储罐中,闭合顶盖,通入氮气,存储罐内的压力 上升至0.7个标准大气压,打开控制阀,使水样通过过滤器流向滤膜支架, 待水样全部通过滤膜支架内的正电荷滤膜后停止进样,关闭氮气存储罐,使 罐体泄压,更换新的存储罐;

步骤二、将pH值为9.5~9.75的牛肉浸提物溶液加入更换后的存储罐内, 通入氮气,存储罐内的压力上升至0.7个标准大气压,打开控制阀,使牛肉 浸提物溶液流向滤膜支架进行洗脱,待全部通过滤膜支架内的正电荷滤膜后 停止进样,通过放水管收集洗脱液,关闭氮气存储罐,使罐体泄压;

步骤三、然后进行等电点沉降法处理后离心,重溶后二次浓缩,再提取 核酸;即完成了札幌病毒的提取。

步骤三所述的等电点沉降法是按下述步骤进行的:利用1.2mol/L HCl 调节洗脱液的pH值至4.0,然后加入获得洗脱液0.1%(V/V)的0.5mol/L FeCl3(约1.8mL),用1.2mol/LHCl调节pH值至3.5。

步骤三在4℃条件下3000×g离心力作用下离心15min。

步骤三所述重溶具体操作:在生物安全柜中,小心弃上清,过程中不要 悬浮沉淀;然后用10mLPBS小心溶解沉淀,转移至50mL离心管中;再加入带 有抗生素的1×MEM至终体积30mL,0.22μM滤器过滤溶液,-70℃保藏备用。

步骤三中二次浓缩是按下述步骤进行的:(一)配制5%牛肉浸提物溶 液:取1.5克牛肉浸提物粉、0.375克甘氨酸、溶解于100mL无菌水中,121℃ 15min高压灭菌;(二)向Centricon Plus-70离心杯式滤器加入70mL去离子 水,以2000g的离心力离心5min,弃滤液;(三)倒置离心杯式滤器连接收 集管,以800g的离心力离心2min;(四)取30mL1.5%牛肉浸提物溶液加 入离心杯式滤器后,以2000g的离心力离心30min,弃滤液;(五)将第一次 过滤后获得的30mL病毒储液加入离心杯式滤器中,以2000g的离心力离心 45min,弃滤液;(六)倒置离心杯式滤器连接收集管,以800g的离心力离 心2min;(七)将收集管中离心产物转移至螺口管中,-70℃保藏备用。

步骤三种利用核酸提取试剂盒Promega MagaZorb Total RNA Mini-Prep  Kit提取札幌病毒核酸。该试剂盒利用磁珠吸附核酸、纯化、洗脱获得核酸 提取物,相对于目前RNA提取常用的TRIzol法和膜吸附试剂盒具有提取效 率高、不含有乙醇等影响后期PCR检出的组分、后期核酸检出效率高的优点。

本发明中水样的清洁程度决定过滤过程所需要的时间,一般情况下清洁 水源需要10min左右,杂质较多的水过滤需要2小时或更长时间。

本发明方法的优点是:病毒提取效率高,在提取过程中,通过利用初滤 除杂、膜吸附、蛋白洗脱、等电点沉降、离心重溶、磁珠试剂盒提取等步骤, 降低了提取产物中干扰组分的含量,使得通过本发明获得的样本提取物能够 适用于多种检测平台。

附图说明

图1是本发明结构的示意图(顶盖处于闭合状态);图2是顶盖的结构示 意图;图3是顶盖与存储罐连接示意图(顶盖处于闭合状态);图1-3中1—— 氮气压力罐,2——存储罐,3——过滤器,4——滤膜支架,5——放水管,6—— 压力表,7——顶盖,8——进气管,9——出水管,10——存储罐,11——穹 顶,12——弧形缩口,13——密封圈,14——外翻沿,15——耳座,16——杠 杆,161——提杆,162——连接杆,163——支撑杆,164——过渡圆弧,17—— 控制阀;图4是SYBRGreen试剂检验水中病毒提取样本扩增曲线;图5是 SYBRGreen试剂扩增熔解曲线;图6是TaqMan试剂检验水中病毒提取样本 扩增曲线。

具体实施方式

具体实施方式一、结合图1、2和3进行说明,本发明的水中病毒分离提 取装置包括氮气压力罐1、存储罐2、过滤器3和滤膜支架4,所述的存储罐 2包括罐体10和顶盖7,罐体10设有穹顶11,穹顶11设有弧形缩口12,顶 盖7底端设有外翻沿14,密封圈13置于外翻沿14内,顶盖7由弧形缩口12 伸入并可通过密封圈13卡在弧形缩口12内,顶盖7顶端对称设有耳座15, 耳座15内装有杠杆16,杠杆16包括一个“n”字形的提杆161、两个弧形的连 接杆162及两个横折形的支撑杆163,所述提杆161两端与连接杆162通过 过渡圆弧164连接,连接杆162的另一端与支撑杆163圆弧过渡连接,杠杆16 的支撑杆163套在耳座15内,支撑杆163的底端可抵在穹顶11上,过渡圆 弧164可抵在穹顶11上,穹顶11上分别设有压力表6、进气管8和出水管9, 存储罐2的进气管8与氮气压力罐1连接,出水管9底端穿过穹顶11伸入到 罐体10底部,出水管9顶端设有控制阀17,控制阀17与过滤器3通过两端 连接快速接头的导管连接,过滤器3与滤膜支架4通过两端连接快速接头的 导管连接,滤膜支架4设有放水管5;所述滤膜支架4内设有正电荷滤膜; 出水管9底端面与存储罐10底部的距离为0.1mm,密封圈13的截面为圆形。

具体实施方式二、结合图1、2和3进行说明,本实施方式与具体实施方 式一不同的是:出水管9底端面与存储罐10底部的距离为0.2mm。其它结 构与连接方式与具体实施方式一相同。

具体实施方式三:结合图1、2和3进行说明,本实施方式与具体实施方 式一不同的是:所述的正电荷滤膜为NanoCeram正电荷滤膜。其它结构与连 接方式与具体实施方式一相同。

具体实施方式四:本实施方式采用具体实施方式三中的装置进行过滤、 洗脱,具体提取方法是按下述步骤进行的:

步骤一、将水样装入存储罐2中,闭合顶盖,通入氮气,存储罐2内的 压力上升至0.7个标准大气压,打开控制阀,使水样通过过滤器流向滤膜支 架,待水样全部通过滤膜支架内的正电荷滤膜后停止进样,关闭氮气存储罐, 使罐体泄压,更换新的存储罐;

步骤二、将pH值为9.5~9.75的牛肉浸提物溶液加入更换后的存储罐内, 通入氮气,存储罐2内的压力上升至0.7个标准大气压,打开控制阀,使牛 肉浸提物溶液流向滤膜支架进行洗脱,待全部通过滤膜支架内的正电荷滤膜 后停止进样,通过放水管收集洗脱液,关闭氮气存储罐,使罐体泄压;

步骤三、然后进行等电点沉降法处理后在4℃条件下3000g离心力离心 15分钟,重溶后二次浓缩,再用核酸提取试剂盒Promega MagaZorb Total RNA  Mini-Prep Kit提取札幌病毒核酸提取核酸;即完成了札幌病毒的提取。

步骤三所述的等电点沉降法是按下述步骤进行的:在生物安全柜中,小 心弃上清,过程中不要悬浮沉淀;然后用10mLPBS小心溶解沉淀,转移至50mL 离心管中;再加入带有抗生素的1×MEM至终体积30mL。

步骤三中重溶具体操作:在生物安全柜中,小心弃上清,过程中不要悬 浮沉淀;然后用10mLPBS小心溶解沉淀,转移至50mL离心管中;再加入带有 抗生素的1×MEM至终体积30mL,0.22μM滤器过滤溶液,-70℃保藏备用。

步骤三中二次浓缩是按下述步骤进行的:(一)配制5%牛肉浸提物溶 液:取1.5克牛肉浸提物粉、0.375克甘氨酸、溶解于100mL无菌水中,121℃ 15min高压灭菌;(二)向Centricon Plus-70离心杯式滤器加入70mL去离子 水,以2000g的离心力离心5min,弃滤液;(三)倒置离心杯式滤器连接收 集管,以800g的离心力离心2min;(四)取30mL1.5%牛肉浸提物溶液加 入离心杯式滤器后,以2000g的离心力离心30min,弃滤液;(五)将第一次 过滤后获得的30mL病毒储液加入离心杯式滤器中,以2000g的离心力离心 45min,弃滤液;(六)倒置离心杯式滤器连接收集管,以800g的离心力离 心2min;(七)将收集管中离心产物转移至螺口管中,-70℃保藏备用。

水中病毒提取过程中,本发明利用自行设计的水体病毒分离提取系统实 施提取,通过阳性滤膜过滤,经过调整电荷洗脱,蛋白沉降包裹及复溶后, 通过RNA提取反转录后获得的cDNA能够应用荧光定量PCR体系检测出阳 性结果。

为对比SYBRGreen染料法与Taqman探针法PCR扩增结果,将两种检测方 法PCR产物进行凝胶电泳检验。检测结果见图4。

本发明能够高效富集水中病毒的设备,利用该设备结合发明中病毒分离 提取方法,应用SYBRGreen染料法和TaqMan探针法两种荧光定量PCR方 法进行检测,都能够成功检出札幌病毒。

由图5可知,在应用SYBRGreen染料法时,融解曲线中74℃左右处有 一个非特异扩增峰,可能由于存在少量引物二聚体干扰,但并不影响阳性检 出结果;

由图6可知,在利用TaqMan探针法进行检测时,检出结果与染料法基 本一致,能够检出水中札幌病毒。

利用荧光定量PCR进行定量及定性检测时,由于不同厂家提供的材料存 在差异,不同反应体系对荧光定量PCR扩增结果有直接影响,在本发明中, 通过本发明提供的分离提取装置和提取方法进行提取时,不同厂商的 SYBRGreen染料试剂和TaqMan探针试剂基本能够在反应中得到相近的结 果,因此本发明适用于多种检测平台。

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