基于灰色理论和分子指纹的药物-靶标结合预测方法

摘要

本发明公开了基于灰色理论和分子指纹的药物-靶标结合预测方法，基于灰色理论GM（1,1）模型生成蛋白质伪氨基酸成分，结合蛋白质序列氨基酸成分将靶标蛋白质序列转换成21维空间向量；通过药物分子指纹软件将药物分子描述成一个256维空间向量；将描述蛋白质序列的21维空间向量和描述药物分子的256维空间向量组合成277维空间向量，作为药物-靶标结合描述符；采用模糊K近邻法对训练集进行训练，得出预测器最佳参数，将药物-靶标结合描述符输入预测器预测药物和靶标是否有关联，本方法不需要测出蛋白质的三维结构，只需蛋白质的一维序列加上药物分子指纹就可预测药物与蛋白质是否可结合，预测成功率高。