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利福平耐药结核菌的检测方法、装置、设备和存储介质

摘要

本申请提供的一种利福平耐药结核菌的检测方法、装置、设备和存储介质,通过获取结核菌全基因组测序相关的文献信息;从所述文献信息中提取全基因组测序数据序列号和利福平耐药突变信息,并依据所述全基因组测序数据序列号下载全基因组测序数据;对所述全基因组测序数据进行处理以提取固定突变;基于所述固定突变的突变位点和对应所述利福平耐药突变信息构建检系统进化树,以鉴定补偿性突变。本申请可以加快检测出临床利福平耐药结核菌是否携带相关的补偿性突变,从而判断出耐药结核菌所在的进化阶段,为临床用药提供指导。随着全球结核菌测序数据的进一步积累,其将反过来进一步提高本发明的检测准确度。

著录项

  • 公开/公告号CN110634538A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-12-31

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海科技发展有限公司;

    申请/专利号CN201910789061.3

  • 申请日2019-08-26

  • 分类号G16C20/30(20190101);G16B20/50(20190101);G16B30/00(20190101);G16B40/00(20190101);

  • 代理机构31219 上海光华专利事务所(普通合伙);

  • 代理人高彦

  • 地址 200052 上海市徐汇区淮海中路1634号3幢514、516、518、519、520、522室

  • 入库时间 2024-02-19 17:04:01

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-01-24

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16C20/30 申请日:20190826

    实质审查的生效

  • 2019-12-31

    公开

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