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基于Hessian正则非负矩阵分解的非编码RNA与疾病关系预测方法

摘要

本发明公开了一种基于Hessian正则非负矩阵分解的非编码RNA与疾病关系预测方法,属于系统生物学领域,主要包括三个步骤:步骤一,分别计算非编码RNA的高斯谱核相似性和疾病的高斯谱核相似性;步骤二,使用迭代求解算法计算非编码RNA‑疾病关联对预测得分;步骤三,根据算出的非编码RNA‑疾病关联对得分进行排序,给出最终预测结果。本发明通过Hessian正则化细致刻画数据内在流形结构,有效利用了阴性样本的信息;l2,1范数约束和近似正交约束保证了编码矩阵的群稀疏性,能减弱噪声数据的影响。本方法能获得比较可靠的预测结果,有效地解决了生物实验方法耗时长、成本高的问题。

著录项

  • 公开/公告号CN110556184A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-12-10

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国人民解放军陆军军医大学;

    申请/专利号CN201910953164.9

  • 发明设计人 汤永;易东;伍亚舟;李高明;

    申请日2019-10-09

  • 分类号

  • 代理机构重庆市信立达专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人陈炳萍

  • 地址 400038 重庆市沙坪坝区高滩岩正街30号

  • 入库时间 2024-02-19 15:57:53

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-01-03

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16H50/50 申请日:20191009

    实质审查的生效

  • 2019-12-10

    公开

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