用于检测基因融合的多重PCR方法、试剂盒和组合物

摘要

本发明涉及用于检测基因融合的多重PCR方法、试剂盒和组合物。用于在分离的基因组DNA中检测至少两个已知的基因融合的存在或不存在的方法，包括使用分离的基因组DNA进行多重PCR。对于每种已知的基因融合，多重PCR使用一个或多个正向引物杂交第一个基因中邻近其融合断裂点位置，并且一个或多个反向引物杂交第二个基因中邻近其融合断裂点位置。引物杂交到相应基因上由多个碱基对隔开的连续隔开的相应位置。检测到的扩增产品分别表示基因融合体的存在。扩增产物可以通过Sanger测序以确定融合断点。通过设计的融合PCR监测鉴定的特异性融合。靶向治疗期间在患者血浆游离DNA中采用多重突变的实时PCR来检测抗药性突变，例如，酪氨酸激酶抑制剂的靶向治疗,来指导二线和三线的靶向治疗。