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甲基化标志物及其在肿瘤诊断、分类中的应用

摘要

本发明公开了一类用于肿瘤早期诊断的甲基化标志物,所述标志物包括HumanMethylation450BeadChip Kit中的248个探针对应的CpG岛,所述标志物能够很好的将训练集中肿瘤的肿瘤组织与癌旁的正常组织区分开。采用所述标志物的甲基化水平构建的机器学习模型不仅能够用来在临床上预测患有训练集的12种肿瘤的风险,同样也可以应用于其它肿瘤,在其它肿瘤中也表现良好,曲线下面积达到0.94;证明本发明筛选的CpG岛的甲基化水平能够用于几乎所有TCGA肿瘤的早期诊断。本发明还提供了HumanMethylation450BeadChip Kit中515个甲基化标志物对应的CpG岛用于肿瘤分类及肿瘤类别的鉴定。

著录项

  • 公开/公告号CN109680060A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-04-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 华东师范大学;

    申请/专利号CN201710962721.4

  • 发明设计人 石铁流;丁武斌;陈庚;

    申请日2017-10-17

  • 分类号C12Q1/6886(20180101);C12N15/11(20060101);

  • 代理机构31257 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人董红曼

  • 地址 200062 上海市普陀区中山北路3663号

  • 入库时间 2024-02-19 08:42:25

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-05-21

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6886 申请日:20171017

    实质审查的生效

  • 2019-04-26

    公开

    公开

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