本发明公开一种稻瘟病抗病基因Pii等位基因的功能特异性分子标记Pii‑N/F及其应用。该分子标记Pii‑N/F由Pii‑N1、Pii‑N2、Pii‑F1及Pii‑F2组成,分别由如SEQ ID NO.1~8所示的引物对Pii‑N1‑F和Pii‑N1‑R、Pii‑N2‑F和Pii‑N2‑R、Pii‑F1‑F和Pii‑F1‑R、以及Pii‑F2‑F和Pii‑F2‑R,从水稻基因组DNA中扩增所得核苷酸序列在凝胶电泳后呈现特异性带型的分子标记。该分子标记能够方便且直接地实现目标基因在水稻种质资源中以及育种后代中的鉴定,且不受环境以及人为因素的影响,有利于高效可靠地利用目标基因加速其筛选及育种的进程。
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