与水稻耐盐性和耐低氧性相关的SNP分子标记及其应用

摘要

本发明公开了与水稻耐盐性和耐低氧性相关的SNP分子标记及其应用。本发明提供的SNP分子标记位于水稻第1号染色体26,874,154位，多态性为A或C。该SNP分子标记与水稻在低氧且高盐萌发条件下的胚芽鞘长度显著相关，该位点基因型为AA的水稻品种在低氧且高盐萌发条件下的胚芽鞘相对长度显著大于基因型为CC的水稻品种。本发明还依据该SNP位点设计了PCR引物，引物的核苷酸序列如序列1和序列2所示。本发明提供的SNP分子标记在自然群体验证表明该标记可以有效预测水稻低氧和高盐萌发性，从而可用于水稻耐盐、耐低氧和直播分子育种标记辅助育种。